Para o projeto da fase 3, Arquitetura Japi junto a uma equipe multidisciplinar desenvolveu os projetos de Reforma e Requalificação dos Armazéns 1, 2 e 3 e também a antiga Casa de Pedra, que tinha a função principal de gerar energia a vapor para o cais e equipamentos do porto. Em trabalho integrado com a Prefeitura de Santos e Autoridade Portuária, o projeto levou em consideração além da integração com as fases 1 e 2, aspectos sociais e mercadológicos que possam garantir a sustentabilidade do empreendimento de maneira a prepara-lo para a futura integração que ele terá com o novo terminal de cruzeiros marítimos, a ser construído na região.